Чтобы запустить выполнение процедуры, нужно выбрать в контекстном меню процедуры пункт «Запустить процедуру». Также можно выбрать один из ее выходных блоков и в его контекстном меню выбрать пункт «Вычислить блок». Запуском процедур управляет специальный планировщик. Если некоторые входные блоки процедуры не рассчитаны, сначала будет запрошено их вычисление, а затем будет запущена сама процедура.
В дереве проекта отображается прогресс выполнения каждой запущенной процедуры. В строке состояния отображается общий прогресс выполнения всех запланированных задач. Пользователь может остановить выполнение процедуры, выбрав в ее контекстном меню пункт «Остановить». При этом все зависящие от нее процедуры также не будут выполнены. При закрытии программы все процедуры останавливаются (сначала запрашивается подтверждение).